Sinopsis:

La Travesía de Miller 4x09
Un magnate de una corporación secuestra a la hermana de Rodney, la Sra. Miller, para intentar obtener el conocimiento de nuevas tecnologías que ella esta desarrollando.

This Mortal Coil (Parte 1) 4x10
Después de que un dron antiguo misterioso choque en Atlantis, el equipo debe saber si los Replicadores pudieron haber encontrado la ciudad... y si la predicción de Davos sobre la destrucción de la ciudad perdida sera verdad. Ademas, las cosas se vuelven mas extrañas cuando reaparece Elizabeth Weir.

Be All My Sins Remember d (Parte 2) 4x11
El equipo espera eliminar a los Replicantes de una vez por todas, reclutando una flota de Naves Colmena para luchar junto al Dedalo y al Apollo. Desafortunadamente, no muchas naves se unen a la causa, y la expedición podría causar una cadena de eventos que no serán capaces de contener.

Spoils of War (Parte 3) 4x12
El equipo de Atlantis localiza una nave Colmena parcialmente dañada que particippó en la anterior batalla contra los Replicantes, en el proceso, descubren información crítica que podría ayudar en su nunca finalizada lucha contra los Wraith.

Quarantine 4x13
Un cierre impuesto de Atlantis atrapa a bastante personal por toda la ciudad con gente que nunca hubieran esperado estar, amenazando con romper varias relaciones que se extienden a traves de toda la expedición... y permitiendo a otras florecer.